伊东甲子太郎已经成为新选组的参谋，他似乎认为距离自己的目标达成，已经越来越近，所以他开始煽动同样抱有尊王攘夷思想的山南敬助，故意引导山南敬助脱离新选组。

由于新选组留下的史料并不完善，后人往往不理解山南敬助身为总长，居然私自从新选组脱逃的行为，实际上山南敬助的突然脱逃，与伊东甲子太郎关系很大。

事实上，山南敬助的心中摇摆不定，他的摇摆并非因为土方岁三制定的、严苛的局中法度，而是因为某些力量的介入，时局已经变得越来越复杂，若是自己贸然采取行动，很可能得不到什么好处，反而把自己给搭进去。

或许是发现山南敬助迟迟不表态，伊东甲子太郎决定主动出击，他私下里找到山南敬助。

为了给出合理的解释，山南敬助只好说：“近藤和土方对风吹草动很敏感，而且南明人也在盯着新选组，所以我认为，现在还不是采取行动的绝佳时机。”

“南明人？啊，我想起来了，虎亲王的侍卫加纳总三郎，现在在新选组当剑术教练——他肯定是虎亲王派来监视新选组的。”

山南敬助试探着问道：“会津中将似乎与南明人的关系不一般，所以虎亲王对新选组做什么事情，他都没有过问。以后我们应该怎么做？”

“去年发生的事情，无不表示南明人和尊王攘夷有着本质冲突，现在我们有三条路可以走。”

短暂的沉默过后，伊东甲子太郎面色严肃地说：“第一条，想办法做掉南明的虎亲王，让南明人不得不离开。第二条，想办法让近藤和土方远离南明人，给我们更多施展机会。第三条，我们直接逃走，去江户谋求其他势力的合作。”

伊东甲子太郎还是希望山南敬助先离开，然后自己再进行打算，说白了，他想让山南敬助先趟雷。

山南敬助不是傻子，他了解伊东甲子太郎的想法，于是说：“虎亲王身边一堆高手，而且虎亲王本人的水平你也知道，暗算这条路根本走不通。无论是近藤还是土方，都不可能因为你和我的三言两语改变看法，更何况土方经常去南明驻地。至于第三条，我觉得，我们还是一起想办法离开比较好。”